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Nuevas Herramientas para análisis de Genomas, Transcriptomas y Proteomas en parásitos

Cierre de solicitud de inscripción: 5 de octubre de 2018. Nuevas Herramientas para análisis de Genomas, Transcriptomas y Proteomas en parásitos. Curso de Posgrado Teórico-Práctico. Fecha de iniciación: 20/11/2018, Fecha de finalización: 24/11/2018. 2 ptos Doctorado FCEyN UBA (en trámite). Dirigido a: Lic. en Biología, Ing. Agrónomos, Bioquímicos, Bioinformáticos, Médicos y carreras afines. Lugar: Universidad de Buenos Aires- CONICET, Buenos Aires, Argentina

 
 
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Curso de Posgrado Teórico-Práctico

Nuevas herramientas para análisis de Genomas, Transcriptomas y Proteomas en parásitos

Fecha de iniciación: 20/11/2018 Fecha de finalización: 24/11/2018

Cierre de solicitud de inscripción: 5 de octubre de 2018.

2 ptos Doctorado FCEyN UBA (en trámite)

Dirigido a: Lic. en Biología, Ing. Agrónomos, Bioquímicos, Bioinformáticos, Médicos y carreras afines.

 

Lugar: Universidad de Buenos Aires- CONICET, Buenos Aires, Argentina

Docentes confirmados:

Dr. Mark Blaxter, Univ Edinburgo, UK

Dr. Dominik Laetsch, Univ Edinburgo, UK

Dra Laura Kamenetzky, IMPAM-UBA-CONICET, FCEyN, UBA

Dra Gisela Franchini, INBILOP-UNLP-CONICET

Dr. Guillermo Daniel Alonso, INGEBI, FCEyN, UBA

Dra. Mara Rosenzvit, IMPAM-UBA-CONICET

Dra. Marcela Cucher, IMPAM-UBA-CONICET

Dr. Lucas Maldonado, IMPAM-UBA-CONICET

Dra. Georgina Stegmayer, UNL-CONICET

Dr. Diego Milone, UNL-CONICET

Dr. Chereji, Razvan, NIH/NICHD, USA

Dr. Gabriel Lichtenstein, IMPAM-UBA-CONICET

Docentes a confirmar

Dr. Hernán Lorenzi, J. Craig Venter Institute, Rockville, Maryland. USA.

 

Programa preliminar

 

1) Parásitos

1.1) Ubicación filogenética y taxonómica de los organismos que se estudiarán durante el curso.

1.2) Ciclos de vida y modos de transmisión

1.3) Concepto teórico de un mundo una salud

1.4) Abordajes genómicos-comparativos

1.5) Relación hospedador parasito Implicancias evolutivas

 

 

2) Genomas

2.1) Generación de datos de genomas y transcriptomas: estrategias disponibles en la actualidad.

2.2) Herramientas de ensamblado disponibles y limitaciones actuales.

2.3) Bases y estrategias de anotación funcional

2.4 Desarrollo de nuevos algoritmos de anotación

2.5) Particularidades de los genomas de parásitos

2.6) Características estructurales y funcionales de los genomas de diferentes grupos taxonómicos.

 

3) Transcriptomas

3.1) Diseño de experimental en RNA-seq

3.2) Aplicación de RNA-seq al estudio de la regulación génica en parásitos

3.3) Nuevas estrategias de análisis de expresión génica

3.4) Desarrollo y utilización de herramientas para el descubrimiento de pequeños RNAs a partir de datos ómicos

3.5) Integración de datos genómicos y transcriptómicos

 

4) Proteómica

4.1) Abordajes fisicoquímicos en estudio de proteínas

4.2)  Estudios omicos para determinación de función de proteínas

4.3)  Integración de datos de proteoma y metaboloma en organismos parásitos.

4.4) Identificación de antígenos para su potencial uso en  diagnóstico.

4.5) Modelado computacional de proteínas: inferencia de función

4.6) Interacción proteína-ligando: desafíos computacionales

 

 

Práctico:

Empleo de herramientas de bioinformáticas en entorno Linux. Ensamblado de genomas, análisis de datos transcriptómicos tanto de RNAs codificantes como herramientas específicas de análisis y descubrimiento de pequeños RNAs no codificantes. Utilización de algoritmos y  bases de datos especializadas para análisis e identificación de biomarcadores y blancos terapéuticos. Utilización de bases de datos de patógenos y estrategias para extraer información (EupathDB, WormBaseParasite y bases de datos locales). Plegamiento de proteínas y dominios funcionales. Se utilizar el Servidor IMPAM-UBA-CONICET del Sistema Nacional de Computación de Alto desempeño (SNCAD), ID 924/2014.

 

Consultas/inscripcion: Dra. Laura Kamenetzky, lauka@fbmc.fcen.uba.ar

———————–ENGLISH VERSION————————————

Postgraduate Course-International Workshop
New Tools for Genomes, Transcriptomes and Proteomes Analysis in Infectious Diseases

Start date: 11/19/2018 End date: 11/23/2018
Directed to: Lic. En Cs. Biologists, Agronomist, Biochemists, Bioinformatics, Doctors and related careers.

Place: University of Buenos Aires- CONICET, Buenos Aires, Argentina

Invited speakers:

Dr. Mark Blaxter, Univ Edinburgh, UK
Dr. Dominik Laetsch, Univ Edinburgh, UK
Dr. Laura Kamenetzky, IMPAM-UBA-CONICET, FCEyN, UBA
Dr. Gisela Franchini, INBILOP-UNLP-CONICET
Dr. Guillermo Daniel Alonso, INGEBI, FCEyN, UBA
Dr. Mara Rosenzvit, IMPAM-UBA-CONICET

Dr. Marcela Cucher, IMPAM-UBA-CONICET
Dr. Lucas Maldonado, IMPAM-UBA-CONICET
Dr. Georgina Stegmayer, UNL-CONICET
Dr. Diego Milone, UNL-CONICET

Dr. Chereji, Razvan, NIH/NICHD, USA

Dr. Gabriel Lichtenstein, IMPAM-UBA-CONICET

 

Speakers to be confirmed:
Dr. Hernan Lorenzi, J. Craig Venter Institute, Rockville, Maryland. USA.

 

Inquiries / inscription: Dr. Laura Kamenetzky, lauka@fbmc.fcen.uba.ar

 


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