Genómica Estructural

Área: Biotecnología | Carácter: Postgrado
Coordinación/Consultas:Laura Kamenetzky lauka@fbmc.fcen.uba.ar

 

Genómica Estructural 2024

Materia de posgrado de la Carrera del Doctorado de la FCEyN-UBA.
La Genómica es una disciplina en constante evolución y expansión. La dinámica de la materias consiste en actividades teórico-prácticos de bioinformática de genómica:
análisis de datos de secuenciación, GBS (genotyping by sequencing), metagenómica/diversidad genómico-taxonómica de microbiota.
Las teóricas ilustrarán cómo desde el conocimiento biológico se pueden diseñar experimentos para abordar la resolución de problemas o hipótesis e ilustrar diferentes formas de analizar estos datos. Las prácticas consistirán en actividades de bioinformática que permitan a los participantes a aplicar métodos especializados para el análisis de datos x-ómicos.

Es una materia de posgrado que se superpone en su dictado con la primera mitad de Genómica Aplicada. Ambas materias se superponen una con la otra y los estudiantes estarán juntos, sin diferencias entre ellos. Atención: Como los contenidos temáticos de este curso se superponen con los de Genómica Aplicada, desalentamos la admisión de estudiantes que la hayan aprobado. En esos casos, la comisión de doctorado no otorgará puntos adicionales por este curso.

Por otro lado, Genómica Estructural es una materia de postgrado diferente de Genómica Funcional , pero ambas son de concepción modular, complementarias y consecutivas entre sí. Se pueden cursar independientemente una de la otra y resulta posible diseñar un plan de cursada específica intercambiando módulos de dedicación equivalente entre ambas materias en base al plan de especialización del alumno.
Dependiendo del cupo de alumnos, existe la posibilidad de proponer combinaciones modulares que le resulten atractivas de forma tal que sumen cargas horarias equivalentes a la de una de las 2 materias.


Foto: Promoción de 2012 en el INTA Castelar

Inscripcion:Para Genómica Estructural: segunda y tercera semana de diciembre de acuerdo con las fechas que establezca el calendario académico de la facultad. Para detalles más específicos como fechas, cronograma, etc visite la página del campus virtual (puede ingresar como invitado).


Foto: Clase de RNAseq a cargo de Sergio González (curso de 2020)

Horarios: Lunas a Viernes de 9 a 17hs
Fecha: primera quincena de febrero
Dedicación total: 80 horas
TPs de laboratorio o de bioinformática: 50 horas
Seminarios de presentación y discusión de publicaciones: 10 horas
Teóricas: 20 horas
Requisitos: Graduados en Ciencias Biológicas o graduados en Ciencias Químicas, Agronomía, Veterinaria, Biotecnología, Bioquímica, Medicina o carreras afines que cuenten con formación previa en biología molecular.
Los postulantes deberán estar familiarizados con la lectura y análisis de publicaciones internacionales en idioma inglés. Cada alumno deberá tener acceso a una
computadora portátil, la cual deberá tener espacio en el disco como para instalar (en una partición) el sistema operativo Linux que se utilizará durante la materia.
Forma de evaluación: Evaluaciones conceptuales sobre el contenido de los TP de bioinformática, resolución domiciliaria de un problema bioinformático con datos nuevos suministrados individualmente a cada alumno, basado en datos propios de la investigación del alumno o provistos por los docentes y Examen final (en caso de no promocionar).

 

Para más detalles, leer la página de Genómica Aplicada o visite la página del campus virtual (puede ingresar como invitado).

Consultas a genomica@fbmc.fcen.uba.ar

Objetivos: 

Enseñar los métodos y modos de razonamiento propios de la investigación genómica y de la bioinformática asociada para resolver problemas de investigación científico-tecnológica. Ejercitar los principales programas bioinformáticos que se utilizan en la actualidad en investigación genómica. Establecer la discusión crítica de resultados de las aplicaciones más relevantes en este campo. Brindar ejemplos de hechos recientes relacionados con la Genómica que tengan impacto económico-social. Estimular el pensamiento reflexivo acerca del estado del conocimiento en los temas de la materia.

Foto: Clase de metagenómica a cargo de Eva Figuerola, Natalia Pin Viso y Paola Talia (curso 2018)

 

Contenidos mínimos:

Mapeo físico y genético de genomas

Secuenciación genómica clásica y de nueva generación

Bioinformática genómica

Genotipificado por secuenciación (GBS) y mapeo por asociación (GWAS)

Metagenómica y caracterización taxonómica de biodiversidad en ecosistemas.

Aplicaciones.

Coordinación:  Laura Kamenetzky

Profesores JTP Ayudantes de 1° Ayudantes de 2°
Esteban Hopp Eva Figuerola  Natalia Gorojovsky
Laura Kamenetzky

Docentes Invitados:

Andrea Puebla (responsable del Servicio de Genómica, UGB-INTA)

Andrés Ribone (bioinformática, INTA)

Carla Filippi (UNMoreno, INTA, CONICET)

Natalia Aguirre (UNMoreno, CONICET, INTA)

Natalia Pin Viso (CONICET, INTA)

Pablo Vera (INTA)

Sergio González (INTA)

Verónica Nishinakamasu (INTA)