Herramientas de Bioinformática Aplicadas a Análisis Genómicos
Curso de Formación Profesional (materia en trámite de formalización)

Es un curso de posgrado que se superpone y se cursa en forma conjunta con la materia Genómica Aplicada y tiene fuertes contenidos de bioinformática genómica.

Se puede cursar como materia de posgrado (se expide un certificado oficial firmado por la Dirección del Departamento de Fisiología, Biología Molecular y Celular (DFBMC) de la Facultad De Ciencias Exactas y Naturales de la UBA (FCEyN-UBA). Está pensada particularmente para aquellos interesados que no están regularmente inscriptos en la carrera del doctorado de la FCEyN-UBA. La materia tiene una organización modular. Los módulos se pueden cursar independientemente uno del otro y resulta posible diseñar un plan de cursada específica intercambiando módulos en base al plan de especialización del alumno. Por ejemplo, un doctorando trabajando en evolución de plantas o moscas, podría no estar interesado en el módulo de metagenómica y no en el módulo de Biología de Sistemas y Fenómica (respetando su ubicación en el cronograma). Un microbiólogo podría no estar interesado en GBS y sí en RNAseq, etc. Es decir, dependiendo del cupo de alumnos, existe la posibilidad de proponer combinaciones modulares que le resulten atractivas de forma tal que sumen cargas horarias equivalentes a la dedicación de una de las 2 materias de posgrado (Genómica Estructural o Genómica Funcional) que son de 80 horas. En todo caso, consultar a genetica@fbmc.fcen.uba.ar. En resumen, se puede cursar la materia completa o solamente aquellos módulos de mayor interés para el cursante siempre y cuando demuestre presencialidad en, al menos, la mitad de las clases obligatorias de la materia (es decir, que tengan un mínimo de 50% de presencialidad comprobada).

Modalidad: Presencial (en el cero-infinito) y una visita al servicio de secuenciación genómica UGB INTA Castelar).

¿Cuándo se dicta?

Se dicta anualmente durante el mes de febrero y primera semana de marzo dependiendo en fechas que varían dependiendo de cuándo caen los feriados de carnaval. Consultar cronograma actualizado en el campus virtual (puede ingresar como invitado).

Inscripción: resultará posible inscribirse en forma condicional (lista de espera dependiente del cupo de 30 alumnos totales) enviando un correo a genetica@fbmc.fcen.uba.ar hasta una semana antes del comienzo de clases (que suelen empezar el 1 de febrero si no cae en día feriado o fin de semana). La inscripción se oficializará cuando reabra la facultad en febrero. A los inscriptos en forma condicional por correo electrónico, se les confirmará que podrán cursar 5 días antes de comenzar las clases que es cuando se pedirá reconfirmación de los inscriptos regulares en diciembre (siempre hay alumnos que se anotan en diciembre por las dudas y después no cursan).

Arancel: El arancel fijado por la facultad es de $6000, el cual se abona a FUNDACEN (fundación Ciencias Exactas) al cual hay que aplicar los descuentos para los que se desempeñen en Universidades Nacionales u otros organismos públicos, miembros de instituciones con las cuales haya convenio de reciprocidad en la exención de aranceles.

Foto: Clase de RNAseq a cargo de Sergio González (curso de 2020)

Requisitos: Graduados en Ciencias Biológicas o Químicas, Agronomía, Veterinaria, Biotecnología, Bioquímica, Medicina o carreras afines que cuenten con formación previa en biología molecular. Los postulantes deberán estar familiarizados con la lectura y análisis de publicaciones internacionales en idioma inglés.

Importante: Para aquellos que no cursan el primer día de clases, deberán contar con conocimientos previos de Linux y R o, alternativamente, estudiar lo que se encuentra en las páginas del campus de la materia de Linux y de R.

Horarios:
Cuatro a cinco veces por semana de 8.30 a 16.30 hs con clases teóricas y de computación. Desde 2017 se organiza en la forma de grandes talleres teórico-prácticos de bioinformática genómica: GBS (genotyping by sequencing), metagenómica/diversidad genómico-taxonómica de microbiota, transcriptómica por RNAseq, biología de sistemas por MapMan y otros nuevos programas, fenómica y genómica de microRNAs. Si bien no se dictará efectivamente clase los 5 días de la semana, los alumnos deberán disponer de los 5 días (de lunes a viernes, de 8.30 a 16.30 hs) porque los talleres no tendrán días fijos.

Las teóricas ilustrarán cómo desde el conocimiento biológico se pueden diseñar experimentos para abordar la resolución de problemas o hipótesis e ilustrar diferentes formas de analizar estos datos. Las prácticas consistirán en ejercicios de bioinformática o biología computacional que permitan a los participantes a aplicar métodos estadísticos para el análisis de los datos bajo la guía de los profesores y docentes auxiliares.

Dedicación total: 160 horas

TPs de laboratorio o de bioinformática: 100 horas

Seminarios de presentación y discusión de publicaciones: 20 horas

Teóricas: 40 horas

Forma de evaluacion: Un parcial teórico integrativo, evaluaciones conceptuales sobre el contenido de los TP de bioinformática, resolución domiciliaria de un problema bioinformático con datos nuevos suministrados individualmente a cada alumno, basado en datos propios de la investigación del alumno o provistos por los docentes y Examen final (en caso de no promocionar).