Ingeniería Genética

Área: Biotecnología y Molecular | Carácter: Electivo
Otorga 5 ptos. para doctorado.
Coordinación/Consultas: mrubins@dna.uba.ar

INGENIERÍA GENÉTICA y BIOLOGÍA de SISTEMAS MOLECULARES – 2020 (modo virtual)

Materia de Grado (Cs. Biológicas, FCEyN, UBA) y Posgrado (5 pts para el Doctorado Cs. Biológicas, FCEyN, UBA)

Comienzo de clases: martes 1 de septiembre 2020

Inscripción: lunes 17 de agosto al domingo 23 de agosto por el Campus Virtual

Teóricas y Seminarios Obligatorios: Martes y Jueves de 6 a 9 PM

Trabajos Prácticos Obligatorios: Miércoles 6 a 8 PM

Taller de Trabajos Prácticos Obligatorio: Lunes de 6 a 8 PM

Refuerzos de TPs: Viernes de 3 a 5 PM (ocasionales)

La materia consta de 3 módulos de teóricas y seminarios y un módulo de TPs (ver flyer adjunto o en el Campus Virtual):

Módulo 1   Marcelo Rubinstein

Estudio de la expresión y función de genes en animales transgénicos y mutantes

¤   Generación y análisis funcional de ratones transgénicos y mutantes.

¤    Peces cebra  y genética molecular del desarrollo de vertebrados.

¤    La revolución de la edición génica: CRISPR/Cas. Knockouts, knockins, mutantes condicionales, mutaciones puntuales. Modelos animales de enfermedades genéticas.

¤    Terapias Genéticas: estrategias de edición génica para el tratamiento de enfermedades de base genética.

Módulo 2     Leonardo Erijman

Genómica y Metagenómica

¤   Microbiomas y funcionamiento de ecosistemas: aplicaciones de la metagenómica en medicina, agricultura, ambiente, bioenergía, forense.

¤   Comunidades de microorganismos y comunidades de genes.

¤   Metagenómica y genomas de organismos no cultivados.

¤   Biología de eco-sistemas: redes de interacciones en ecosistemas microbianos.

Módulo 3:     Alejandro Colman-Lerner

Biología de Sistemas Moleculares

¤   Motivos moleculares recurrentes en redes bioquímicas.

¤   Comportamientos cuantitativos dinámicos resultantes de cascadas de reacciones: respuestas graduales, “switches” y osciladores moleculares.

¤   Aplicación a sistemas de transducción de señales, ciclo celular y decisión de destino celular.

¤   Introducción al modelado teórico/práctico utilizando ecuaciones diferenciales ordinarias.

Trabajos Prácticos (virtuales)

Cross-talk entre dos vías de señalización de MAPK

¤ Procesamiento y análisis de imágenes biológicas con Image J

¤ Biología celular cuantitativa con reporteros fluorescentes, FRET, co-localización

¤ Programación de macros en ImageJ y automatización del procesamiento de imágenes de microscopía

¤ Modelado de procesos biológicos con COPASI

Docentes de TP: Lucía Durrieu (coordinación), Martín Storz, Guillermo Juárez, Giuliano Antelo

Consultas a Marcelo Rubinstein   mrubins@dna.uba.ar

Ingeniería Genética tiene como única materia correlativa Genética I de la Carrera de Cs. Biologicas-FCEyN-UBA.

Régimen de aprobación: Se tomarán tres parciales, uno al final de cada módulo. Los parciales se aprueban con 4 (cuatro). La nota para promocionar es 7 o más en cada uno de los tres parciales teóricos y aprobación de los Trabajos Prácticos. Sólo pueden recuperarse parciales desaprobados. Los tres parciales pueden recuperarse una sola vez cada uno en recuperatorios que serán tomados, en caso de ser necesario, en fechas separadas. Para aprobar los Trabajos Prácticos se exige un mínimo de 80% de asistencia a las clases obligatorios y aprovar la evaluación final.

En caso de promocionar, la nota final será resultado de la nota promedio de los tres parciales teóricos,  nota de concepto de los seminarios y desempeño en evaluaciones e informes de los TPs. Los alumnos que aprueben los Trabajos Prácticos y los parciales teóricos pero que no alcancen la promoción directa deberán rendir el examen final que abarca toda la materia incluido las teóricas y los seminarios.

Los alumnos de posgrado interesados en cursar la materia deberán enviar un CV a mrubins@dna.uba.ar antes del viernes 14 de agosto para solicitar cursar la materia, en el que prueben haber cursado materias que les hayan aportado los conocimientos necesarios para poder cursar Ingeniería Genética. Los seleccionados deberán luego inscribirse a través de la página del Campus Virtual de la Facultad hasta el 23 de agosto.

 

Ver EADIS

Objetivos:
Ingeniería Genética es una materia modular que profundiza en diversos tópicos de importancia fundamental en la biología molecular, genómica funcional y biología de sistema moleculares desde una perspectiva tanto mecanística como tecnológica aplicada la resolución de problemas celulares y de sistemas en áreas de ciencia básica y aplicada como la salud humana y la biotecnología.

Contenidos mínimos:
Expresión génica en eucariotas.
Regiones regulatorias de la transcripción.
Epigenética y dinámica de la cromatina.
Transgénesis en mamíferos: ratones y animales de granja.
Desarrollo de modelos animales de enfermedades humanas y aplicaciones biotecnológicas a partir de modificaciones en el genoma.
Transgenes de fusión.
Proteínas reporteras.
Ablación celular y tisular.
Mutantes: genética directa y reversa.
Recombinación homóloga en células embrionarias multipotentes (ES cells).
Ratones mutantes nulos (knockout).
Ratones mutantes con cambios de función (knockin).
Ratones mutantes condicionales con control temporal y/o espacial. Recombinación somática.
Integrasa Phi31C, recombinasa Cre y Flipasa.
Sistemas inducibles a nivel transcripcional y post-transcripcional.
Mutaciones dirigidas al genoma.
Nucleasas acopladas a zinc fingers, TALEs y CRISPR.
Transgénesis en pez cebra. Morfolinos antisentido y knockdown de genes.
Aplicaciones comerciales de transgénesis animal.
Diseño, construcción y uso in vivo de vectores virales.
Metagenómica: de los genes a los genomas.
Metagenómica y ecosistemas: medicina, agricultura, ciencias ambientales, y bioenergía.
Proteómica funcional.
Interacciones proteína-proteína.
Networking.
Producción proteica de alto rendimiento.
Proteómica estructural.
Geles de dos dimensiones.
ICAT. Espectrometría de masa.
Fosfoproteómica.
Proteómica cuantitativa e intracelular.
Protein Microarrays: “kinase chips”.
Biología de Sistemas Moleculares.
Motivos moleculares en redes bioquímicas.
Comportamientos cuantitativos dinámicos emergentes.
Respuestas graduales.
Switches y osciladores moleculares.

rofesores JTP Ayudantes de 1° Ayudantes de 2°
Marcelo Rubinstein Lucía Durrieu Giuliano Antelo
Alejandro Colman Lerner Martín Stortz Guillermo Juárez
Jorge Muschietti (BBE)
Leonardo Eijman